Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Igkv1-99F6XWB2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms