Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Taf4E9QAP7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms