Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc74aE9Q9U8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc74aE9Q9U8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms