Protein–RNA interactions for Protein: E9Q956

Mcmdc2, Minichromosome maintenance domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcmdc2E9Q956 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mcmdc2E9Q956 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mcmdc2E9Q956 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mcmdc2E9Q956 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mcmdc2E9Q956 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mcmdc2E9Q956 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mcmdc2E9Q956 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mcmdc2E9Q956 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcmdc2E9Q956 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcmdc2E9Q956 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcmdc2E9Q956 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcmdc2E9Q956 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcmdc2E9Q956 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcmdc2E9Q956 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcmdc2E9Q956 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcmdc2E9Q956 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcmdc2E9Q956 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mcmdc2E9Q956 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms