Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Urb2E9Q7L1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Urb2E9Q7L1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Urb2E9Q7L1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Urb2E9Q7L1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Urb2E9Q7L1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Urb2E9Q7L1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Urb2E9Q7L1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Urb2E9Q7L1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Urb2E9Q7L1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Urb2E9Q7L1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Urb2E9Q7L1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Urb2E9Q7L1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Urb2E9Q7L1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Urb2E9Q7L1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Urb2E9Q7L1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Urb2E9Q7L1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Urb2E9Q7L1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Urb2E9Q7L1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Urb2E9Q7L1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Urb2E9Q7L1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Urb2E9Q7L1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Urb2E9Q7L1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Urb2E9Q7L1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Urb2E9Q7L1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Urb2E9Q7L1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Urb2E9Q7L1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Urb2E9Q7L1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms