Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D7

1700024B05Rik, RIKEN cDNA 1700024B05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700024B05RikE9Q6D7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700024B05RikE9Q6D7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700024B05RikE9Q6D7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700024B05RikE9Q6D7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700024B05RikE9Q6D7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700024B05RikE9Q6D7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700024B05RikE9Q6D7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
1700024B05RikE9Q6D7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700024B05RikE9Q6D7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700024B05RikE9Q6D7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700024B05RikE9Q6D7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
1700024B05RikE9Q6D7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700024B05RikE9Q6D7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms