Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ythdc1E9Q5K9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ythdc1E9Q5K9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms