Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BC005561E9Q5E2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BC005561E9Q5E2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BC005561E9Q5E2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms