Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm20518E9Q548 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20518E9Q548 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20518E9Q548 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20518E9Q548 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm20518E9Q548 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20518E9Q548 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20518E9Q548 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm20518E9Q548 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
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Gm20518E9Q548 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm20518E9Q548 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm20518E9Q548 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Gm20518E9Q548 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gm20518E9Q548 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20518E9Q548 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gm20518E9Q548 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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