Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ApobE9Q414 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
ApobE9Q414 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms