Protein–RNA interactions for Protein: E9Q271

Wdr17, WD repeat domain 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr17E9Q271 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Wdr17E9Q271 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wdr17E9Q271 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms