Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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