Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc171E9Q1U1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc171E9Q1U1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms