Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Pdzd2E9Q1M1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
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Pdzd2E9Q1M1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Pdzd2E9Q1M1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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