Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cdr1E9Q0B4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdr1E9Q0B4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms