Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm9972E9Q053 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm9972E9Q053 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms