Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ryr1E9PZQ0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms