Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Parp4E9PYK3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Parp4E9PYK3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms