Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sbf2E9PXF8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sbf2E9PXF8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms