Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl3lE9PWZ3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl3lE9PWZ3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms