Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6L3

Vmn2r49, Vomeronasal 2, receptor 49, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r49D3Z6L3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vmn2r49D3Z6L3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms