Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms