Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Gm3543D3Z235 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm3543D3Z235 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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