Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc8D3YZV8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc8D3YZV8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms