Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fam47eD3YWC7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fam47eD3YWC7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms