Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptprz1B9EKR1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptprz1B9EKR1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms