Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmf1B9EKI3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmf1B9EKI3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmf1B9EKI3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms