Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Cttnbp2B9EJA2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Cttnbp2B9EJA2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cttnbp2B9EJA2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms