Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Phf11bB4XVQ1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phf11bB4XVQ1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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