Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Phf11cB4XVP9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Phf11cB4XVP9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms