Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah3B2RWG3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Siah3B2RWG3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms