Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usf3B2RUQ2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usf3B2RUQ2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usf3B2RUQ2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms