Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PtprbB2RU80 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprbB2RU80 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms