Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc22a28B2RT89 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Slc22a28B2RT89 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms