Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfc3h1B2RT41 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfc3h1B2RT41 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfc3h1B2RT41 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfc3h1B2RT41 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfc3h1B2RT41 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfc3h1B2RT41 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfc3h1B2RT41 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfc3h1B2RT41 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfc3h1B2RT41 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfc3h1B2RT41 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfc3h1B2RT41 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfc3h1B2RT41 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfc3h1B2RT41 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfc3h1B2RT41 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms