Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Brpf3B2KF05 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brpf3B2KF05 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms