Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CK137956B1AYM9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CK137956B1AYM9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms