Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpruB1AUH1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtpruB1AUH1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms