Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp36B1AQJ2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp36B1AQJ2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms