Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11127A7VMS2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm11127A7VMS2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm11127A7VMS2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm11127A7VMS2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm11127A7VMS2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm11127A7VMS2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Gm11127A7VMS2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11127A7VMS2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11127A7VMS2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm11127A7VMS2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11127A7VMS2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm11127A7VMS2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11127A7VMS2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11127A7VMS2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11127A7VMS2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11127A7VMS2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11127A7VMS2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11127A7VMS2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11127A7VMS2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11127A7VMS2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11127A7VMS2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11127A7VMS2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11127A7VMS2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11127A7VMS2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11127A7VMS2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11127A7VMS2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11127A7VMS2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11127A7VMS2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11127A7VMS2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11127A7VMS2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm11127A7VMS2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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