Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skint4A7TZF3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skint4A7TZF3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skint4A7TZF3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Skint4A7TZF3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skint4A7TZF3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skint4A7TZF3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Skint4A7TZF3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Skint4A7TZF3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skint4A7TZF3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms