Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttll11A4Q9F4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ttll11A4Q9F4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms