Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CatsperbA2RTF1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CatsperbA2RTF1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms