Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Upf2A2AT37 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Upf2A2AT37 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms