Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc163A2AGD7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc163A2AGD7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms