Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930447F04RikA2AFR2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930447F04RikA2AFR2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms