Protein–RNA interactions for Protein: A2A9H6

Gm884, Predicted gene 884, mousemouse

Predictions only

Length 3,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm884A2A9H6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm884A2A9H6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm884A2A9H6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms