Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930433I11RikA0A0U1RPT6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms