Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4921501E09RikA0A0R4J054 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms