Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE3

Trbv15, T cell receptor beta, variable 15 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv15A0A0A6YYE3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv15A0A0A6YYE3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trbv15A0A0A6YYE3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv15A0A0A6YYE3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv15A0A0A6YYE3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv15A0A0A6YYE3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv15A0A0A6YYE3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv15A0A0A6YYE3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv15A0A0A6YYE3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv15A0A0A6YYE3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trbv15A0A0A6YYE3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms